Каржы министрлиги алдыдагы жылдары бюджетти толук программалык негизде жүргүзүүнү пландап жатат. Мындай ыкма каражат бөлүнгөн мекемелердин ишинин натыйжалуулугун арттырып, каражатты максатка ылайык жана үнөмдүү пайдаланганга шарт түзөт. Бюджетти программалык негизде жүргүзүү ыкмасы буга чейин пилоттук негизде эки министрликке киргизилген.